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巴斯夫助力科研團(tuán)隊(duì),尋找有效成分對(duì)抗新冠病毒

2020/6/19 15:31:30??????點(diǎn)擊:
巴斯夫開放其包含數(shù)百萬條目的物質(zhì)庫,供科研團(tuán)隊(duì)免費(fèi)使用

超級(jí)計(jì)算機(jī)Quriosity助力公共研究項(xiàng)目識(shí)別并優(yōu)化潛力分子

作為“‘手’護(hù)”行動(dòng)的一部分,巴斯夫不僅捐贈(zèng)了大量消毒劑和防護(hù)口罩,還在全球范圍內(nèi)為學(xué)術(shù)研究團(tuán)體提供支持,幫助尋找合適的活性成分,用于治療感染新冠肺炎的患者。巴斯夫生物科學(xué)研究平臺(tái)總裁Peter Eckes博士表示:“雖然我們沒有藥物活性成分研發(fā)業(yè)務(wù),但巴斯夫在物質(zhì)研究方面擁有超過150年的經(jīng)驗(yàn)。這意味著我們擁有大量的相關(guān)知識(shí)和囊括多種活性成分的大型物質(zhì)庫。”巴斯夫還開發(fā)了自己的計(jì)算機(jī)程序,用于分子設(shè)計(jì),并擁有自己的超級(jí)計(jì)算機(jī)Quriosity。Eckes補(bǔ)充道:“充分發(fā)揮我們強(qiáng)大的研究能力,為抗擊新冠疫情貢獻(xiàn)一份力量。”為此,巴斯夫正通過多種方式幫助尋找病毒解藥。

為快速找到有效抑制新冠病毒的活性成分,世界各地的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)正通過細(xì)胞培養(yǎng)測(cè)試已批準(zhǔn)藥物的有效性,雖然這些藥物已用于治療其他病毒性疾病,但可能對(duì)新冠病毒作用有限,因此有必要尋找活性成分的改進(jìn)衍生物。為此,巴斯夫研究人員對(duì)公司內(nèi)部包含數(shù)百萬種分子的物質(zhì)庫進(jìn)行了計(jì)算機(jī)輔助搜索,以尋找類似的化合物,并最終確定了150種有希望的候選化合物。巴斯夫免費(fèi)向各大學(xué)術(shù)工作團(tuán)隊(duì)提供這些化合物,并允許其用于研究,無需支付任何專利費(fèi)。巴斯夫生物科學(xué)研究員Matthias Witschel博士說道:“多年來,我們一直在支持瘧疾等傳染病的藥物學(xué)術(shù)研究。因此,‘手’護(hù)行動(dòng)才能迅速調(diào)用我們?cè)缫呀⒌娜嗣}和流程。” 

 用超級(jí)計(jì)算機(jī)Quriosity模擬活性分子

來自計(jì)算化學(xué)部的化學(xué)家們提出了第二種尋找活性成分的方法,即利用計(jì)算機(jī)領(lǐng)域知識(shí)。隨后,他們得知一家生物技術(shù)公司PostEra正開展COVID-19 Moonshot項(xiàng)目,參與該項(xiàng)目的全球科學(xué)家自愿幫助尋找一種抑制劑,通過抑制新冠病毒必需的一種酶——病毒主蛋白酶,阻止病毒在人體內(nèi)自我復(fù)制。巴斯夫研究人員也加入其中,共同尋找有效抑制劑,在巴斯夫內(nèi)部開發(fā)的計(jì)算機(jī)程序和超級(jí)計(jì)算機(jī)Quriosity的幫助下設(shè)計(jì)出許多新型分子。最終,他們通過模擬找到了20個(gè)最適合主蛋白酶活性位點(diǎn)的分子,并將相關(guān)分子信息免費(fèi)提供給該項(xiàng)目,作進(jìn)一步研究。 


來自計(jì)算化學(xué)部的化學(xué)家們提出了第二種尋找活性成分的方法,即利用計(jì)算機(jī)領(lǐng)域知識(shí)。隨后,他們得知一家生物技術(shù)公司PostEra正開展COVID-19 Moonshot項(xiàng)目,參與該項(xiàng)目的全球科學(xué)家自愿幫助尋找一種抑制劑,通過抑制新冠病毒必需的一種酶——病毒主蛋白酶,阻止病毒在人體內(nèi)自我復(fù)制。巴斯夫研究人員也加入其中,共同尋找有效抑制劑,在巴斯夫內(nèi)部開發(fā)的計(jì)算機(jī)程序和超級(jí)計(jì)算機(jī)Quriosity的幫助下設(shè)計(jì)出許多新型分子。最終,他們通過模擬找到了20個(gè)最適合主蛋白酶活性位點(diǎn)的分子,并將相關(guān)分子信息免費(fèi)提供給該項(xiàng)目,作進(jìn)一步研究。 
巴斯夫數(shù)字生物科學(xué)研究部的計(jì)算化學(xué)主任Klaus-Jürgen Schleifer教授解釋道:“然而,這些通過計(jì)算機(jī)模擬得來的分子,我們并不確定它們能否被合成,合成度有多高。”針對(duì)這一問題,巴斯夫研究人員也在嘗試第三種尋找活性成分的方法:借助超級(jí)計(jì)算機(jī),對(duì)所有候選化合物進(jìn)行測(cè)試。這些化合物原則上可以由COVID-19 Moonshot項(xiàng)目的合約制造商之一合成。Schleifer說道:“可能的化合物多達(dá)約12億種,我們就其抑制新冠病毒主蛋白酶的潛力進(jìn)行一一計(jì)算。”使用超級(jí)計(jì)算機(jī)計(jì)算的優(yōu)勢(shì)在于,所有可能的活性分子都可以快速合成,然后在實(shí)驗(yàn)中接受測(cè)試。巴斯夫?qū)⑼ㄟ^COVID-19 Moonshot項(xiàng)目公開這些結(jié)果。

Eckes說道表示:“非常高興可以發(fā)揮我們?cè)诨瘜W(xué)方面的特殊專長(zhǎng)支持藥物活性成分研究,并為學(xué)術(shù)研究團(tuán)隊(duì)提供真實(shí)和虛擬的活性分子。這或許有助于早日研發(fā)出抗新冠藥物。”

幫助學(xué)術(shù)研究團(tuán)體尋找抗新冠活性成分是巴斯夫“‘手’護(hù)”行動(dòng)的眾多舉措之一。在全球范圍內(nèi),巴斯夫計(jì)劃投入總額超過1億歐元的抗疫資金。更多濾芯膠請(qǐng)?jiān)L問s1l6e.cn